首先你们要确定自查补报的那笔税款是属于那个年度的，一般情况下，如果税务机关不作硬性要求，你们可以按本年度发生数（这样处理一会计上好处理，二可以减少企业应交的滞纳金）。 二、你们要确定自查补报那笔税款属于什么性质，是作为库存货物非正常损失而转出进项税补税，还是作核增销售收入补税。 作出选择后，填份“企业自查补报纳税情况表”到税务机关，看他们怎么说，如果不提出意见，补税后再根据自查补报填写的情形进行帐务处理。
公司注销了怎么补税
法律分析：公司注销前进行清算是要补交实收资本印花税、账本印花税、房屋租赁税，还有各种欠税和各种罚款。如果公司是一般纳税人公司，还需要补交税务局核定缴纳增值税，所得税。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》 第十六条 从事生产、经营的纳税人，税务登记内容发生变化的，自工商行政管理机关办理变更登记之日起三十日内或者在向工商行政管理机关申请办理注销登记之前，持有关证件向税务机关申报办理变更或者注销税务登记。境外企业在中国境内承包建筑、安装、装配、勘探工程和提供劳务的，应当在项目完工、离开中国前15日内，持有关证件和资料，向原税务登记机关申报办理注销税务登记。
增值税一般纳税人怎样补交税款
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怎样办理加工贸易转内销的补税手续？
企业在加工贸易方式下出口过程中，由于经营需要将出口货物转内销等原因，需要办理中期补税，加工贸易转内销补税，企业应递交以下申请材料：
1、制成品内销补税申请；
2、制成品单耗表；
3、制成品折算原材料明细表；
4、进口原材料入区报关单；
5、内销合同、发票、箱单；
6、内销货物所对应监管条件的相关凭证；
7、国产料件入区单据（制成品全部使用保税进口料件的除外）；
8、制成品分摊制造费用明细表（制成品使用国产料件的除外）；
9、海关认为必要的其他单证。
凭以上资料到海关部门办理补税即可。
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